Sendo as questões da Saúde distribuídas por diversos domínios e localizações regionais, o Instituto de Ciências da Saúde obedece a uma organização nacional, tendo, assim, uma Direcção Nacional e um Director Adjunto em cada Centro Regional:

• Director: Prof. Doutor Alexandre Castro Caldas
   
• Director Adjunto do Centro Regional do Porto: Profª Doutora Margarida Vieira 
   
• Director Adjunto do Centro Regional de Viseu: Profª Doutora Marlene Barros
   
• Diretora Executiva: Drª Maria Clara Melo
   
• Assessora de Direcção: Drª Debora Oliveira
   
• Gestão Financeira: Drª Maria João Pacheco
   
• Marketing e Comunicação: Drª Joana Borges de Almeida 

Secretariado de cursos:
Otília Calheiros
Zita Bento